Une ligne verticale à faisceau extrait de la microsonde nucléaire a été conçue et est à présent dédiée à l'irradiation, et ce plus particulièrement en mode ion par ion. Le faisceau en provenance de l'accélérateur Van de Graaff est dévié verticalement, collimaté par un capillaire, puis extrait à l'air au travers d'une fenêtre de Si3N4 de 200 nm d'épaisseur. On minimise ainsi les différentes contributions au stragglings géométriques et énergétiques, rendant possible l'utilisation d'un microfaisceau de quelques micromètres de diamètre avec une énergie bien définie. L'installation d'irradiation est équipée d'un microscope à fluorescence permettant de suivre in situ des processus biochimiques à l'aide de marqueurs. l'ensemble a été conçu de façon à être au plus proche des conditions de culture biologiques standard; ainsi un incubateur entoure la platine d'irradiation et permet de mimer des conditions physiologiques. Les puits de culture d'irradiation sont basées sur des boites de Petri standard, et ne nécessitent pas de manipulations particulières. Il est donc possible d'envisager des expériences d'irradiations biologiques de longue durée.
Ce dispositif permet également d'étudier des phénomènes radiologiques fondamentaux, comme l'exploration de la propagation spatio-temporelle des espèces réactives générées lors du passage d'un ion énergétique dans une solution.