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Frédéric GOBEAUX

Service Interdisciplinaire sur les Systèmes Moléculaires et Matériaux (UMR 3299)

Nimbe (Service Nanoscience et Innovation pour les Matériaux, la Biomédecine et l'Energie)

Laboratoire Interdisciplinaire sur l'Organisation Nanométrique et Supra Moléculaire

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Status

CNRS Research associate / Chargé de recherche au CNRS

Research interests

I am interested in the supramolecular assemblies of biological or biomimetic molecules. For instance, my PhD thesis work was devoted to understanding the physico-chemical conditions that rule type I collagen self-assembly in vitro. We could build biomaterials mimicking biomaterials such as skin or bone, whose main component in vivo is collagen.

Recently, I have focused my effort on the study of amyloid-like assembly of short peptides.

My goals are to understand the kinetics and mechanisms of assembly from the atomic level up to the supramolecular level i.e., from the ångström to the millimeter. This wide range of scales requires combining different techniques of structural characterization: optical and electron microscopy, x-ray scattering and vibrational spectroscopies. I also occasionally use microfluidics tools.

 

Read more on my ongoing project on the self-assembly of functional amyloids.

 


 

Mes travaux de recherche s'intéressent principalement à l’étude physico-chimique d’auto-assemblages biologiques ou biomimétiques. Par exemple, au cours de mon travail de thèse j’ai étudié différents aspects des auto-assemblages du collagène de type I, une protéine structurale majeure des tissus conjonctifs chez les vertébrés.

Plus récemment, je me concentre sur l'étude d'assemblages peptidiques de type amyloïde.

Mes objectifs sont de contrôler les conditions physico-chimiques et de comprendre les mécanismes d’auto-assemblage depuis le niveau atomique jusqu’au niveau supramoléculaire (de l’angström jusqu’au millimètre). Pour ce faire, je combine différentes techniques de caractérisation : microscopies (optique et électronique), diffusion du rayonnement (SAXS, DLS) et spectroscopies vibrationnelles (infrarouge, Raman). Je me suis aussi intéressé au développement d’outils microfluidiques pour la cristallisation des protéines.

 

Projet en cours sur les assemblages d'amyloïdes fonctionnelles.

 

Previous positions/Education

2009-2012

 CEA Saclay - iBiTec-S, SB2SM, URA 2096, Équipe Assemblages Supramoléculaires

                   Institut de Physique de Rennes UMR 6251, Équipe Biophysique

Supervision: Dr. Maïté Paternostre & Dr. Franck Artzner

2007-2009

Brandeis University, Complex Fluids Group (Waltham, MA, USA)
Supervision: Prof. Seth Fraden

2004-2007

Thèse de doctorat de l’Université Pierre et Marie Curie (Paris 6)

Phases denses de collagène de type I : transition isotrope/cholestérique, firillogenèse et minéralisation

Dirigée par : Dr. Gervaise Mosser Laboratoire de Chimie de la Matière Condensée de Paris

                                                                      (Équipe Matériaux du Vivant, CNRS-EPHE UMR 7574).

                    Dr. Patrick Davidson Laboratoire de Physique du Solide (CNRS UMR 8502)

2001-2004 École Nationale Supérieure de Chimie de Paris (Chimie ParisTech)

 

Publications

Peptide self-assembly

"Directing peptide crystallisation through curvature control of nanotubes."
F. Gobeaux, C. Tarabout, N. Fay, C. Meriadec, M. Ligeti, D.-A. Buisson, J.-C. Cintrat, F. Artzner & M. Paternostre
Journal of Peptide Science (2014) 20 (7) 508-516
 

"Experimental observation of double-walled peptide nanotube and monodispersity modeling of the number of walls."
F. Gobeaux, N. Fay, C. Tarabout, F. Meneau, C. Mériadec, C. Delvaux, J.-C. Cintrat, C. Valéry, F. Artzner, and M. Paternostre
Langmuir (2013) 29 2739−2745

"Structural role of counterions adsorbed on self-assembled peptide nanotubes."
F. Gobeaux*, N. Fay, C. Tarabout, M. Ligeti, D. Alexandre-Buisson, J.-C. Cintrat, K.M.H. Nguyen, C. Valéry, F. Artzner & M. Paternostre
Journal of the American Chemical Society (2012) 134 (1); 723-733

“Control of peptide nanotube diameter by chemical modifications of an aromatic residue involved in a single close contact.”
C. Tarabout, S. Roux, F. Gobeaux, N. Fay, E. Pouget, C. Meriadec, M. Ligeti, M. IJsselstijn, F. Besselievre, D. Alexandre-Buisson, J.-M. Verbavatz, M. Petitjean, C. Valéry, L. Perrin, B. Rousseau, F. Artzner, M. Paternostre, J.-C. Cintrat
Proc. Natl. Acad. Sci. USA  (2011) 108 19 7679-7684

Microfluidics

"Mapping and manipulating temperature-concentration phase diagrams using microfluidics."
S. Selimovic, F. Gobeaux, S. Fraden

Lab on a Chip (2010) 10 (13) 1696-1699

Biomineralization

"In vivo inspired conditions to synthesize biomimetic hydroxyapatite"
N. Nassif, F. Martineau, O. Syzgantseva, F. Gobeaux, M. Willinger, T. Coradin, S. Cassaignon, T. Azais, M.-M. Giraud-Guille
Chemistry of Materials (2010) 22 (12) 3653-3663

"Self-assembled collagen-apatite matrix with bone-like hierarchy"
N. Nassif, F. Gobeaux, J. Seto, E. Belamie, P. Panine, P. Davidson, G. Mosser, P. Fratzl, M.-M. Giraud-Guille
Chemistry of Materials (2010) 22 3307–3309

Collagen self-assembly

“Power law rheology and strain-induced yielding in acidic solutions of type I-collagen.”
F. Gobeaux, E. Belamie, G. Mosser, P. Davidson, S. Asnacios
Soft Matter (2010) 6 3769-3777

"Fibrillogenesis in dense collagen solutions: a physico-chemical study"
F. Gobeaux, G. Mosser, A. Anglo, P. Panine, P. Davidson, M.-M. Giraud-Guille, E. Belamie
J. Mol. Biol. 376 (2008) 1509-1522

"Liquid crystalline properties of type I collagen: perspectives in tissue morphogenesis" (Revue)
M.-M. Giraud Guille, E. Belamie, G. Mosser, C. Hélary, F. Gobeaux, S. Vigier
Comptes-Rendus Chimie 11 (2008) 245-252

"Cooperative ordering of collagen triple helices in the dense state"
F. Gobeaux, E. Belamie, G. Mosser, P. Davidson, P. Panine, M.-M. Giraud-Guille
Langmuir 23 (2007) 6411-6417

"Possible transient liquid crystal phase during the laying out of connective tissues: alpha-chitin and collagen as models"
E. Belamie, G. Mosser, F. Gobeaux and M.-M. Giraud-Guille
J. Phys.: Condens. Matter 18 (2006) S115–S129

Divers

"Calibration and quality assurance procedures at the far UV linear and circular dichroism experimental station DISCO"
F. Wien, M. Paternostre, F. Gobeaux, F Artzner and M. Refregiers
J. Phys.: Conf. Ser. 425 (2013) 122014

Pictures

 

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