Dans la cellule bactérienne, le matériel génétique est dans un état compact et condensé. Par exemple, le nucléotide, c'est à dire la structure qui contient le chromosome bactérien associé à des protéines, est typiquement de l'ordre quelques centaines de nanomètres, alors que la longueur de l'ADN est d'environ 1 mm. Le génome est donc compacté d'environ un facteur mille.

L'objectif de ce projet de thèse consiste à coupler différentes méthodes pour caractériser les structures nucléoprotéiques bactériennes. Cette approche multidisciplinaire sera développée au sein du laboratoire Léon Brillouin au CEA ,en collaboration avec un groupe du synchrotron SOLEIL (ligne DISCO). L'étudiant recruté étudiera plus particulièrement une nouvelle façon de structurer l'ADN en utilisant une protéine bactérienne formant des structures amyloïdes, appelée Hfq.

La condensation de l'ADN induite par les protéines amyloïdes associées aux neuropathologies a déjà été décrite, mais ici, la région amyloïde de Hfq sert la physiologie de la cellule en permettant d'assurer la compaction de l'ADN in vivo. Analyser l'interaction de Hfq avec l'ADN s'avère donc primordial afin de mieux comprendre la compaction du chromosome bactérien et ses conséquences fonctionnelles. Les retombées attendues pour ce projet de thèse seront doubles, du point de vue du développement méthodologique pour l'analyse des nanostructures nucléoprotéiques et des perspectives pour la mise au point de nouveaux antibiotiques.