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Univ. Paris-Saclay
Mécanismes de réduction des ponts disulfures dans les protéines révélés par spectroscopie Raman et calcul moléculaire
Catalina DAVID
Laboratoire CSPBAT, UFR SMBH, Université Paris 13
Mercredi 20/10/2010, 10:00
NIMBE Bât 546, p.21, CEA-Saclay

Les ponts disulfures jouent un rôle crucial dans la stabilité de la structure native des protéines. L'étude du mécanisme de leur réduction est importante pour comprendre leurs fonctions. Je vous présenterai l'étude du rôle de la structure des protéines dans la réactivité des ponts disulfures. En utilisant deux approches, une expérimentale, la spectroscopie Raman et l'autre théorique, la modélisation moléculaire, nous avons étudié le mécanisme de la réduction des ponts disulfures dans le lysozyme par la phosphine TCEP. Les résultats expérimentaux obtenus ont été soumis à un traitement qui nous a donné accès à des paramètres physico-chimiques cruciaux dans la compréhension du mécanisme étudié : les enthalpies libres de réaction et les enthalpies libres du dépliement local de la structure protéique. Les analyses de cinétiques de réaction nous ont permis de déterminer avec précision les constantes de vitesse de réaction et de mettre en évidence les différences de réactivité entre les ponts S-S. Ces résultats expérimentaux ont été affinés en utilisant la modélisation moléculaire. La méthode de calcul utilisée a été la méthode QM-FE qui nous a permis de déterminer les enthalpies de réaction et les voies de réaction. Ces résultats seront discutés en relation avec les données expérimentales. Je terminerai ma présentation en présentant le domaine des Nano Biocapteurs SERS (Surface Enhaced Raman Scattering) pour l'application au diagnostic précoce des pathologies.

Contact : Serge PIN

 

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